A EPCM possui uma Comissão Científica formada por uma equipe multidisciplinar de pesquisadores de alto nível de excelência mestres, doutores e pós-doutores que englobam as áreas das Ciências da Saúde e Ciências Humanas e Sociais.
Esta Comissão avalia as propostas de pesquisa que entram na Instituição, colaboram em parcerias de pesquisa e orientam alunos de iniciação científica e de pós-graduação stricto-sensu e lato-sensu.
Com isso a pesquisa na EPCM tem um papel significativo na contribuição da geração de conhecimento, pois é através da pesquisa que o profissional avança na assistência, na capacidade de criar, criticar, melhorar implantando assim novas tecnologias, fármacos, e metodologias que promovam o avanço no campo da Medicina.